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研究实验室自动化:用于药物发现和生命科学的机器人

如何加速研究实验室工作流程? 液体处理,高吞吐量<unk>查,样本准备和化合物合成自动化.

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机动实验室24/7进行实验,使用液体处理的<1%的简历,每天检查10万个化合物,并以无法匹配的速度生成数据.本指南涵盖平台,集成架构和ROI.

为什么要自动化研究实验室

实验室自动化的基础是三个柱子:

  • 通过** 一个运行生物化学测试的人类研究人员每天检查96种化合物 (一块).一个自动化HTS系统每天检查50,000100,000种化合物.差异决定药物发现运动是否具有商业可行性.
  • 24/7运行 自动系统在夜间和周末运行,不需加班费用.一个需要3个月的人类查的复合图书馆需要2天的自动HTS.候选人提名的速度直接影响临床试验时间.

核心自动化工作流程

  • 液体处理 微升分发,稀释系列,反应剂添加.体积:50nL 1ml范围.系统:Tecan Evo,汉密尔顿STAR,贝克曼Coulter Biomek.CV <1%在1μL.用于:测试设置,化合物稀释,ELISA,qPCR设置.
  • 板块操纵 SBS标准微板 (96-, 384-, 1536-well) 是HTS的普遍容器.机器人板块处理器 (Orbitor RS,KiNEDx) 将板块移动在仪器之间:化器,读器,洗衣机,密封器.一个完整的HTS线每天处理5002,000块板块.
  • **高吞吐量查 (HTS) ** 每天5万100,000个化合物测试. 完全集成系统:化合物管理机器人 →液体处理器 → 化器 → 盘子阅读器 → 数据捕获. 一位生物化学家运营一个5仪器的HTS线,否则需要20多名研究人员.
  • 自动化复合存储 复合库 (100,0002M复合物) 存储在自动化冷藏库 (20°C到80°C).

平台比较

Vendor System Throughput Price Range Best For
Tecan Freedom EVO 150/200 20K–50K assays/day (integrated) $150K–400K Mid-size HTS, genomics, ELISA
Hamilton STAR Line 50K–100K assays/day $200K–600K Large HTS, high-precision dispensing
Beckman Coulter Biomek i7 10K–30K assays/day $100K–300K Flexible research, method transfer
UR3e + custom Custom cell Task-specific $50K–200K Novel assay types, prototype workflows

智能化集成

机动化实验室以创造新机遇的速度生成数据,

  • 板图分析 高内容成像系统 (PerkinElmer Opera Phenix,分子设备 ImageXpress) 在吞吐量捕获细胞形态图像.缩神经网络分类细胞现象,检测到形态变化,并分类超人吞吐量的器官. 例如:在一天内进行100个化合物 × 10个度 × 5个细胞类型的配置.
  • **SAR建模 (结构与活动关系) ** 机器学习模型 (图神经网络,变形器) 从分子结构预测生物活动.训练有素的SAR模型优先考虑从1M化合物库测试1000个化合物,从而降低了99×的实验成本.
  • ** 试验设计的贝叶斯优化** 活跃学习系统 (Elude, Phoenics, Summit) 建议基于所有先前结果下一个实验. 证明在20%的实验数量与网格搜索中找到最佳的配方条件. 特别强大于连续参数优化 (pH,温度,度梯度).

监管要求

  • 21 CFR 11 部分 (FDA) 电子记录和签名必须进行审计,访问控制,并且不可重复.每一个管道操作,板块运动和结果都必须可追踪到操作员,仪器和时间标签.大多数实验室自动化软件包括11 部分合规模块.
  • GMP验证 良好的制造实践要求在监管环境中使用的仪器进行验证:IQ (安装资格),OQ (运营资格),PQ (性能资格).主要供应商的验证包价格每种仪器为10K50K.
  • **CSV (计算机系统验证) ** 控制自动化实验室设备的软件系统必须根据GAMP 5指导方针进行验证.验证包括用户要求规范,功能规范和测试协议.

集成架构

现代自动化实验室集成多层:

  • **LIMS (实验室信息管理系统) ** 用于样本跟踪,测试规划和结果存储的中央数据库.通过SiLA2或定制驱动器连接到所有仪器. 杆,IDBS和LabVantage是企业常用的选择.
  • 仪器控制软件 每个仪器供应商都提供了一个规划器或API. 德卡纳的流量控制,汉密尔顿的VENUS,贝克曼的方法编辑器.越来越多地,SiLA2 (实验室自动化标准化) 实现供应商-无知仪器控制.
  • ML训练数据湖 原始仪器输出 (板阅读器CSV,图像TIFF堆) 流入云数据湖 (AWS S3,Azure Data Lake).正常化到一个共同的方案.ML模型训练以历史测试数据预测复合活动,识别板件文物,并指导下一次实验.

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通过实验室自动化加速研究

斯威尔士药物研究中心与制药,生物技术和学术实验室合作,设计和部署用于药物发现和生命科学研究的自动化工作流程.

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